La primera noticia documental conocida acerca de esta ermita data del año 1540.
En el Archivo Diocesano de Pamplona consta que a comienzos del siglo XVII fueron seroras de la ermita de San Telmo, María Juaniz de Oro y Magdalena de Duana.
Desde principios del siglo XVII es la sede de la Cofradía de Mareantes de San Telmo.
Preside su altar un retablo barroco de finales del siglo XVII.
Este inmueble está declarado Bien Cultural Calificado por Decreto del Gobierno Vasco 14/2000 de 25 de Enero.
OBRAS SUBVENCIONADAS
Rehabilitación de la cubierta, reponiendo las vigas deterioradas y aplicando a toda la madera un tratamiento antihumedad y contra insectos xilófagos.
IMPORTE DE LA SUBVENCION
Plan 1995: 1.000.000 ptas.