Juan Araoz uriarte mondragoetarrak, 1575eko ekainaren 13an egindako testamentuan, bere ondarea utzi zuen San Frantzisko komentua sortzeko.
Komentua eta eliza XVII. mendearen hasieran eraiki zuten anaia Migel Aranburu arkitektoaren proiektuaren arabera.
Aldare nagusiko erretaula barrokoa XVII. mendearen bukaerakoa da eta Jakobo Ayestak eta Rafael Sarraldek egin zuten.
Eraikin hau kultur ondasun kalifikatu izendatuta dago, 1964ko urtarrilaren 17ko Ebazpenez.
SUBENTZIONATUTAKO OBRAK
Zimendu eta karga-hormen egitura indartzea, erretaula zaharberritzea eta elizaren eta komentuen eta elizaren estaldurak zaharberritzea.
SUBENTZIOAREN ZENBATEKOA
1994ko Plana: 2.000.000 pta.
1995eko Plana: 3.000.000 pta.
2004ko Plana: 120.000 €
2005eko Plana: 120.000 €
2006ko Plana: 42.000 €